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Los rayos X y electrones son de naturaleza electrónica e interfieren con el entorno electrónico. Hay elementos con poca corteza y por tanto hidrógenos y átomos muy ligeros no se pueden determinar con las técnicas de difracción de Rayos X o con difracción de electrones. La alternativa es utilizar proyectiles que impacten sobre los núcleos y por ello se desarrolló la difracción de neutrones.
Los neutrones caen dentro del campo del núcleo e inciden sobre objetivos nucleares, y es por ello que es una técnica utilizada principalmente por físicos.